一、《楞伽经详解》七第82页：【由有第八识含藏无明及行支业种，故有名色之六识缘于六入触受爱等，而流转生死有海之中，成就十二因缘流转门之“名色缘六识，六识缘爱…”等六识生死流转法。】
1.流转门应是名色缘六入，怎么是缘六识呢？2.六识若是识支，当缘名色，怎么缘爱呢？即使此处六识为六入，六入怎能跳过触受而直接缘爱呢？
答：《楞伽经详解》第七辑82页：【由有第八识含藏无明及行支业种，故有名色中之六识缘于六入触受爱等，而流转生死有海之中，成就十二因缘流转门之“名色缘六识，六识缘爱……”等六识生死流转法。】乃是正确的说法，透过六识生死流转法的现观，能够推知此世名色的出生，乃是缘于过去世六识的造作，故有此世名色后有的出生，黠慧者若欲了知此世名色的出生，必会推究观察十二因缘流转门，了知此皆过去世之六识造作为缘因，而此六识造作却是因“无明覆、爱缘系”的缘故，而有六识身等法存在，若能做到“无明断、爱缘尽”就能“身坏命终，更不复受”，如《杂阿含经》卷12（二九四经）中 世尊之开示：【尔时，世尊告诸比丘：“谛听！善思！当为汝说。诸比丘！彼愚痴无闻凡夫，无明所覆，爱缘所系得此识身。彼无明不断、爱缘不尽，身坏命终，还复受身。还受身故，不得解脱生、老、病、死、忧、悲、恼、苦。所以者何？
此愚痴凡夫本不修梵行向正尽苦、究竟苦边故。是故身坏命终，还复受身。还受身故，不得解脱生、老、病、死、忧、悲、恼、苦。若黠慧者，无明所覆、爱缘所系得此识身。彼无明断、爱缘尽。无明断、爱缘尽故，身坏命终，更不复受。不更受故，得解脱生、老、病、死、忧、悲、恼、苦。所以者何？彼先修梵行正向尽苦、究竟苦边故。是故彼身坏命终，更不复受。更不受故，得解脱生、老、病、死、忧、悲、恼、苦。是名凡夫及黠慧者，彼于我所修诸梵行种种差别。”】故《楞伽经详解》中说“名色缘六识，六识缘爱……”。
再者，因缘法的义理乃是甚深极甚深，若欲于因缘观能真实了知，唯有三乘见道迹之贤圣方能知之，因为不论是从流转门、还灭门、顺观、逆观、出离观、安隐观、十因缘法、十二因缘法、真实法、假号法……等诸多层面，都是根据法界实相的基础所显现因果的现象；所以对于最微细因果现象所展现的因缘观，二乘圣人基于信受佛语的加持而能现观了知少分，诸证悟菩萨则因所证无生法忍智与所集福德的多寡深浅，而能了知多分、更多分，若论究竟了知，唯佛乃能究竟。
再者，同类的问题亦曾有多次提问而回复，如正觉电子报三十二期〈般若信箱〉问四、问六、问九、三十九期问二； 平实导师更于《阿含正义》多辑亦有专章详细的开示因缘观之正理及各种观行细节要领，劝请诸有志亲证因缘观者，至各大实体书局及网络书籍请购《阿含正义》诸辑拜读。
二、《念佛三昧修学次第》第110─111页：“当他观想 弥陀世尊成就的时候，这个观想的心就是报身佛……这个心的本身也就是佛(报身佛)。”第122页：“这个法门观的时候，要离开前五识，要用第六识来观，用第七识来想……纯粹用我们的第七识来想……。”
《正法眼藏─护法集》【第176页：“佛的一心三身和一切明心见性者的一心三身一样：一、法身，即真如(或阿赖耶识)，不是佛性。二、报身，即是佛性，不是见闻觉知。三、应身，即是见闻觉知。不是六根，因为六根无知。”第333页：“佛性是直接由阿赖耶识作用，但也不离五阴六入见闻觉知，佛性不是第七识……。”】
《念佛三昧修学次第》的两段话，明显地说第七识是报身佛。而《护法集》这一段话又明确说，报身，即是佛性。这不等于说第七识即报身即佛性吗？而《护法集》第二段话却又说佛性不是第七识。这是怎么回事呢？
答：这是从一心三身来说，或是从观想的法门来说；也可以从不同层次来说三身，这就是法无定法的意思。这里面的说明，有些是未悟的人所能理解的，有些则是真正开悟的人才能理解的，有些则是眼见佛性的人才能理解的，也有一些是已入地菩萨随顺佛性以后才能理解的。若从观想念佛法门来说，想要成就观想念佛的实证，依照《观经》所说：“所以者何？诸佛如来是法界身，遍入一切众生心想中；是故汝等心想佛时，是心即是三十二相、八十随形好；是心作佛，是心是佛，诸佛正遍知海从心想生。”此时是依凡夫异生地的知见来说的，所以观想 阿弥陀佛身相成就时，就说那时的影像是佛，而说正在观想的觉知心即是自性佛；但这个自性佛当然不可能是自己的法身佛，这时能观的心是觉知心意识，能想的心是意根，即是自己的报身佛；而诸佛的报身也是要由意根与意识来共同成就的，所以《观经》才会说“是心作佛、是心是佛”。这是纯粹由凡夫异生地所能理解的层次来说。
但若是从一心三身来说，则又不同，这就不是明心而未见性的大乘贤者（在解脱道中至少相当于初果或二果）所能知道的；这时则是以真如心第八识为自性法身佛，是以真如心第八识的心所法应现出来的佛性作为报身佛，以意根、意识作为自性应身佛、自性化身佛。自性法身佛是真如第八识，是明心者所能亲见的，却不是凡夫异生等凡夫所能了知的，也不是阿罗汉等二乘愚人所能了知的；至于法身的性用──由第八识显现出来的佛性及作用──则非真正开悟明心的人所能了知的，而是只有眼见佛性的贤圣才能了知的，故在眼见佛性时方便说为报身佛，因为已经亲自眼见第八识的见分了；至于其更深细的照见与了知，则是诸地菩萨才能亲见，并非初见佛性或见性后仍在十行、十回向位的贤圣所能了知，更可说为一心三身中的报身佛。若是从二乘愚人及凡夫异生位来说，则只能看见意根与意识和合运作时的情况，即是意根与意识共同显示出来的情况，故说意根与意识为化身佛。佛性既是由第八识直接显示出来，当然只有眼见佛性的人才能少分知之；至于佛性的作用，则非未入地菩萨随顺佛性者所能知之，必须入地以后才能了知，当然是属于诸地所见的一心三身中的报身佛了；未入地者是绝无可能亲见一心三身中的报身佛作用的。所以从这个层次来说的报身佛，就是指第八识出生的佛性的作用了。
再者，如同 世尊对凡夫异生或二乘愚人说“第八识离见闻觉知”，但是对已悟之人却又说“第八识有觉有知，能了知众生心行”，对于已入地菩萨则说第八识所能了知的，是更深细、更广大的分别性，故说“于无分别中能广分别”，同样是对不同层次的人说不同的法义，此即是为人悉檀，故说法无定法，依照根器的不同，而说不同层次的法义。若是尚未明心者，对于这些问题的探究，于自己之道业并无帮助；因为这是眼见佛性后，再经历一段长时间进修般若别相智及一切种智以后，才需要探讨的问题；并不是想要探讨就有能力探讨的，因为这是牵涉到种智内容的甚深法，不是一般开悟或见性的菩萨所能探讨的。未悟者或初悟者乃至初见性者，探讨此一问题时，都将无法正确的理解，有可能会产生偏差而导致谤法、谤圣的状况出现，故应该小心谨慎的处理才好；若是明心后或尚未明心者，想要藉此探讨来求得眼见佛性的境界，是永无希望的，因为眼见佛性的证境并不是靠法义的探讨所能成就的。
三、看有情，可见自、他佛性；看无情、可见自佛性。若见一小虫卧而不动，不知死活，已见性不退之人，可见小虫之佛性吗？(有时所见之小虫，其实只是一空壳)。
答：问三所说并无错误，但在已死之小虫身上看不见它的佛性，却可看见自己的佛性。关于佛性的眼见，必须依止善知识的教导而修学，在这些问题上所作的探究，永远无法使自己得以眼见佛性；亦有人在《佛性论》上面研究，终其一生也都无法眼见；故此问题的探讨，无益于道业。而且见性极难，除了必须定力、慧力、大福德以外，更须有适当的时节因缘；若时节因缘不适合，纵使真善知识有心帮忙，也无法成愿，以此缘故，正觉同修会中已有三百余人明心，但眼见佛性者至今仍然唯有十余人，显现其特难也！有真善知识指导尚且如此，何况寻经觅论而在文字与思惟上探究者，更无论矣！于此再指出见性所必须之条件：定力、慧力、大福德。此三者具足时，犹须等待时节因缘，此时节因缘却是难以强求者，要真善知识愿意相助，也要时节恰当，眼见佛性所以难者正在于此。
四、《平实书笺》第101页：【……然其庄严报身变化为初生童子形象，于摩耶夫人右胁而生……然于色身沐浴已毕，便入住色身……】
1.报身化为童子，童子就是化身吧？色身当为应身，那么这时即法、报、应、化四身具足。第八无垢识法身在哪个身里？还是法身同时持报、应、化三身？2.报身入住色身，还是报身所化之童子(化身)入住色身？3. 世尊以兜率下生示现成佛，下生前，在兜率的，是报身还是应身？下生以后，此位就由 弥勒菩萨接替了吗？那么，此时 世尊还未示现涅槃，未上色究竟天，色究竟天就没有报身佛吗？4.报身即是意生身？
答：1.与2.：应身与化身通常说为同一类身，故无四身之说；但应身有色蕴长时间存在人间，化身则是感应化现之后随即灭失。其次，已悟之人都知道第八识法身此时应该是在何处，入胎之后又在何处，故不需再提此问；若是未悟之人，于此问题则是问了也无助于开悟明心，反而容易误会而导致错悟，故此问题亦不宜给与答复。
3.最后身菩萨在兜率天中，尚无庄严报身，但有三种意生身。下生人间以后，兜率天中亦无最后身菩萨，亦无等觉菩萨住持，彼时诸菩萨都应追随下生于人间，奉侍已下生之佛。最后身菩萨成佛之后，可以有庄严报身示现在色究竟天为十方前来的诸地菩萨说法。
4.意生身不同于庄严报身，否则三地满心菩萨亦应有庄严报身，亦应成为三地满心即已成佛，则与理有违。
五、《公案拈提》第七辑373页【由身入通达位中故，发起极喜之心，始入相见道位中，成为初地入地心。】与《灯影》第68页所说【初地通达位之见道，必须函盖二种见道：真见道与相见道。要须具足此前后二种见道者，方可通达初地入地心所应具备之般若智慧，方名通达位菩萨；是故通达位亦是见道所摄，始从七住位明心之般若总相智── 根本无分别智──发起时，末至初地入地心时之般若道种智初起时之通达位止，皆是见道位所摄。不可说“唯有初地之入地心位方是见道位”，应说初证现在阿赖耶识── 未来初地真如心体──之时亦是见道位，不可唯说进修至初地时方是见道位，是故初地入地心之通达位，亦是见道所摄，乃是具足二种见道后之见道位，由其通达般若之总相与别相故，说为通达位。】为何不同？
答：查《公案拈提》第七辑373页此句确有错误，感谢您的来函指正；此句已在2006年加印第二刷时更正为：“由身入通达位中故，发起极喜之心，始‘圆成’相见道位，成为初地之入地心。”已改为“圆满成就”相见道位功德，感谢大德来函指正。
六、在礼拜多尊佛菩萨时，如何无相而有区分？还是在他们因地时的菩萨行及大愿之总体印象上区分呢？
答：1.无相念佛中礼拜多尊佛的修习要领、内涵与次第，乃 平实导师依于道种智证量，以及禅定上的实证体验，为此界末法时期慧多定少之学子而施设修习定力之法，期使具大乘善信者能够习得此一修习胜妙动中定的方便善巧，其目的乃是为求明心见性者所需之思惟观功夫而作准备；若将拜多尊佛的功夫练习纯熟之时，即可让十住菩萨眼见佛性所需的基本定力趋于成熟，转而有能力看话头、参究佛性；然此时还需待见性该有的慧力与大福德同时具足圆满，方可由诸佛菩萨及大善知识导引之因缘而一念相应，以父母所生肉眼亲见佛性，当下证得世界身心如幻之现观。
故若以眼见佛性的亲证来说，透过修习无相念佛拜多尊佛之功夫，而成就思惟观之定慧力就非常重要了。然而欲成就拜多尊佛的功夫，得要先有拜一尊佛的定力成就，若无法成就无相念佛拜一尊佛之净念相继功德，想要成就拜多尊佛思惟观的功德，那是不可能的，因为拜多尊佛功夫的成就，乃是以拜一尊佛的定力为基础，若无此净念相继的定力为基础，终究无法成就拜多尊佛之功德。多有学佛人欲成就拜多尊佛之动中定，却不肯老实的在拜一尊佛的阶段下手用功，这就如同世间愚者，以为可免除打地基及建设一楼之辛苦，而欲直接建造顶楼，此乃是愚痴无智的想法。
至于如何无相而有区别，这得要回归无相念佛中对“无相”的定义之了解，此中要领在各地的禅净班课程，诸亲教师都会详细的开示，并教导此分用功方式与转折要领，您若是本会学员，请您向亲教师求法；若非学员，您可以参加各地新班共修，或者参考《无相念佛》及《念佛三昧修学次第》书中开示，此处篇幅有限，不再赘言。
2.对于诸佛菩萨的了别，可以从各佛菩萨的别愿、功德、国土……等众多的差别义来作简择，此分思惟观的简择慧乃是需要以拜一尊佛的定力为基础；若动中定的功夫不够，而欲成就拜多尊佛之思惟观的功德，那是不可能的。因为拜多尊佛主要在训练“观”的部分，这当中的要点，乃是禅净班课程诸亲教师会特别注重教导的。拜一尊佛的功夫主要是在训练动中“止”的功夫，拜多尊佛乃是著重在“观”上面用功，但是止观乃须双运俱行而互为增上的，非唯练观而成就之。换句话说，拜多尊佛的功夫，需要依靠拜一尊佛的功夫来增上；若无这个基本功夫，单靠思惟是无法成就的。